酚氯仿抽提DNA原理和方法-赛默飞

DNA 提取的核心挑战:为何选择酚-氯仿抽提法?1. 酚-氯仿抽提法的提取步骤样品制备:使生物样品均质以完成细胞裂解。对于细胞,在适当体积的裂解缓冲液中重悬。对于组织,在液氮中研磨,然后在裂解缓冲液中重悬。细胞裂解:在55°C下孵育1-2小时或直到样品完全裂解。必要时在裂解缓冲液中加入蛋白酶K。苯酚-氯仿萃取:在裂解的样品中加入一体积苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),用手彻底旋转或摇动约20秒。相分离:16000 × g室温离心5分钟,小心地除去上层水相,将层转移到新的管中。确保移液过程中不要携带任何苯酚。进入下面的“乙醇沉淀方案”。Reagent Volume Glycogen (20 μg/μL) 1 μL7.5 M NH4OAc 0.5 × volume of sample100% ethanol 2.5 × (volume of sample +NH4OAc)按上表所列的顺序,将下列试剂加入水相。

将试管置于-20°C过夜,从样品中沉淀DNA。注意:如果您希望继续该方案,请将试管置于干冰或-80°C中至少1小时。

将样品在4℃16000 × g下离心30分钟,使cDNA成球。

小心地除去上清,不要干扰cDNA微球。

加入150 μL 70%乙醇。4°C, 16000 × g,离心2分钟。小心取下上清。

重复步骤3一次。尽可能多地去除剩余的乙醇。

cDNA颗粒在Thermo Scientific SpeedVac浓缩器中干燥2分钟或在室温下干燥5-10分钟。

将cDNA微球悬浮于50-100 μL TE缓冲液或无核酸酶的水中,上下移液30-40次。

使用分光光度法(例如,Nanodrop)或琼脂糖凝胶运行等分液来测量DNA浓度和纯度。

2.酚-氯仿抽提法的优势酚-氯仿抽提法是一种经典的有机溶剂抽提技术,其原理基于不同生物大分子在水相与有机相中的溶解度差异:

酚:有效变性和沉淀蛋白质;氯仿:去除脂类杂质并防止泡沫形成;异戊醇:减少 DNA 损失,提高回收率。该方法适用于多种样本类型(如细胞、组织、血液),尤其适合需要大量 DNA 或对纯度要求较高的实验。

酚氯仿提取法能有效去除核酸中的蛋白质和脂质,从而获得相对纯净的 DNA 样本。该方法利用 DNA、蛋白质和脂质在这些溶剂中的不同溶解性,将 DNA 从其他细胞成分中分离出来。酚用于变性和提取蛋白质,而氯仿用于提取脂质。此方法适用于多种样本类型,包括细胞、组织和某些体液。它既适用于小规模也适用于大规模的 DNA 提取。

3. 酚-氯仿抽提法的局限性尽管酚-氯仿抽提法具有成本优势,但也存在以下问题:

操作复杂:需多次离心、移液,步骤繁琐;安全性风险:酚和氯仿具有毒性,需通风柜操作;耗时较长:从裂解到最终溶解可能需要数小时;重复性差:人为操作误差影响结果一致性。